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Linum trigynum - Tajima's D estimates per population

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figshare.scilifelab.se2024-10-30 更新2025-01-21 收录
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资源简介:
Whole genome Tajima's D estimates for individuals of all population of L. trigynum per 100 kb windows. It is part of this article: Gutiérrez-Valencia, J., Zervakis, P. I., Postel, Z., Fracassetti, M., Losvik, A., Mehrabi, S., ... & Slotte, T. (2024). Genetic causes and genomic consequences of breakdown of distyly in Linum trigynum. Molecular Biology and Evolution, msae087. https://doi.org/10.1093/molbev/msae087 Estimations were done using vcftools v.0.1.16 on a filtered vcf file. File's descriptions: CHROM = the chromosome's name START = the start position of the 100 kb window END = the end position of the 100 kb window TajimaD = the estimated value of Tajima's D for that window List of the populations: population 01 population 03 population 04 population 06 population 07 population 08 population 10 population 11

针对L. trigynum所有种群个体,以每100 kb窗口为单位的全基因组Tajima's D估计值。此数据集收录于Gutiérrez-Valencia等(2024)发表的文章《Linum trigynum异花授粉破裂的遗传原因和基因组后果》中。研究采用vcftools v.0.1.16版本在过滤后的vcf文件上进行了估计。 文件描述如下: CHROM = 染色体名称 START = 100 kb窗口的起始位置 END = 100 kb窗口的终止位置 TajimaD = 该窗口的Tajima's D估计值 种群列表: 种群01 种群03 种群04 种群06 种群07 种群08 种群10 种群11
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SciLifeLab
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