µgreen-db

Here, we set up a reference database, called µgreen-db, for the plastidial 23S rRNA gene. The sequences were retrieved from either generalist (NCBI, SILVA) or Comparative RNA Web (CRW) databases, in addition to a more original approach involving recursive BLAST searches to obtain the best sequence recovery.

本研究构建了一款针对质体23S核糖体RNA基因（23S rRNA gene）的参考数据库，命名为µgreen-db。该数据库的序列来源于通用数据库（NCBI、SILVA）与比较RNA网络（Comparative RNA Web, CRW），同时还采用了一种更具创新性的递归BLAST搜索方法，以实现最优的序列回收率。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

µgreen-db是一个针对质体23S rRNA基因的参考数据库，旨在支持光合真核微藻和蓝藻群落的生态学研究。该数据库整合了来自NCBI、SILVA等公共数据库的序列，并通过递归BLAST搜索优化序列恢复，覆盖了多个分类群的物种，在元条形码分析中展现出高分配率。