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Define Secondary Structure of Proteins

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知名数据库2026-06-02 收录
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https://www.pdb-redo.eu/dssp
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资源简介:
The DSSP algorithm (Kabsch & Sander, Biopolymers. [1983] 22:2577-2637) annotates the secondary structure of protein structures in detail, including hydrogen bonding and beta sheet topology. The DSSP databank provides these annotations for all structure models in the Protein Data Bank (PDB). The annotations are available in two formats: annotated mmCIF files (preferred) and the DSSP format (deprecated).

DSSP算法(Kabsch与Sander,《生物聚合物》,1983年,第22卷:2577-2637页)可详尽注释蛋白质结构的二级结构,涵盖氢键与β折叠(beta sheet)拓扑结构。DSSP数据库可为蛋白质数据银行(Protein Data Bank,PDB)中的所有结构模型提供此类注释。此类注释支持两种格式:带注释的mmCIF文件(推荐优先使用)以及DSSP格式(已弃用)。
提供机构:
荷兰癌症研究所
搜集汇总
数据集介绍
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背景与挑战
背景概述
该数据集基于DSSP算法,为蛋白质数据银行(PDB)中的所有结构模型提供详细的二级结构注释,包括氢键和β折叠拓扑信息。注释数据以mmCIF和DSSP两种格式提供,支持在线检索和批量下载。
以上内容由遇见数据集搜集并总结生成
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