类器官领域潜在突破性研究文献知识发现报告

类器官属于三维（3D）细胞培养物，包含其代表器官的一些关键特性。此类体外培养系统包括一个自我更新干细胞群，可分化为多个特异性的细胞类型，与对应的器官拥有类似的空间组织并能够重现对应器官的部分功能，从而提供一个高度生理相关系统。迄今，来源于多种器官的类器官业已面世，包括脑、肠道、胃、舌、甲状腺、胸腺、睾丸、肝脏、胰腺、皮肤、肺、肾、心脏及视网膜等。除了来源于健康组织的类器官，大量疾病模型（包括肿瘤模型）的类器官也不断涌现，为新药开发提供了绝佳模型，以作为动物实验的有力补充。目前对突破性研究（breakthroughdiscoveries）尚无公认的定义，PonomarevIV等在识别已知的突破性论文和高被引论文的典型引用模式过程中，发现突破性论文获得较多的引用而且能够为当下的研究提供新的方向。在Science评选的年度科学突破中，其新闻副主编RobertCoontz表示：科学突破应该是起到两种作用中的一种，或者解决了一个人们长时间苦思冥想的问题，或者为许多新研究开启了大门。基于以上两者对突破性研究的理解，本报告将突破性研究界定为在渐进式研究中做出重大发现，或在原有研究基础上的颠覆、变革，并为研究提供了新方向。本报告将从类器官领域研究进展、类器官领域潜在突破性研究文献识别和类器官领域突破性研究文献的知识发现三部分进行阐述。为了识别类器官领域的潜在突破性研究文献，利用Mesh主题词“Organoids”在PubMed上检索近五年的文献，共5314篇。论文对应的引文语料利用日本国家生命科学数据库中心基于PMC-OAS开发的Colil（Commentsonliteratureinliterature）平台，通过文章的PMID在Colil平台检索获取。5314篇论文共对应47650篇引文。利用训练的“摘要模型”和“引文模型”分别对类器官领域文献集进行识别，分别识别突破性文献2026和720篇（精确度>0.9），两者结合在一起共同识别出突破性文献257篇。从257篇突破性文献中选取被3篇及以上突破性引文（精确度>0.9）引用的文献共48篇，再通过专家打分来验证这48篇是否具有较高的研究价值。