Ternary complex crystal structure of DNA polymerase Beta with 5-carboxy-dC (5-caC) at the templating position

Ternary complex crystal structure of DNA polymerase Beta with 5-carboxy-dC (5-caC) at the templating position Descriptor: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]guanosine, DNA (5'-D(*CP*CP*GP*AP*CP*(1CC)P*GP*CP*GP*CP*AP*TP*CP*AP*GP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*CP*TP*GP*AP*TP*GP*CP*GP*C)-3'), ... Authors: Batra, V.K, Wilson, S.H. Deposit date: 2018-11-14 Release date: 2019-03-27 Last modified: 2023-10-11 Method: X-RAY DIFFRACTION (2.457 Å) Cite: Molecular basis for the faithful replication of 5-methylcytosine and its oxidized forms by DNA polymerase beta. J.Biol.Chem., 294, 2019

本数据集为模板位携带5-羧基脱氧胞苷（5-carboxy-dC，简称5-caC）的DNA聚合酶β（DNA polymerase Beta）三元复合物晶体结构。相关参数如下：修饰物为2'-脱氧-5'-O-[(R)-羟基{[(S)-羟基(膦酰氧基)磷酰基]甲基}磷酰基]鸟苷；所用脱氧核糖核酸（DNA）序列分别为5'-D(*CP*CP*GP*AP*CP*(1CC)P*GP*CP*GP*CP*AP*TP*CP*AP*GP*C)-3'、5'-D(*GP*CP*TP*GP*AP*TP*GP*CP*GP*C)-3'，序列未完全列出。作者：巴特拉（Batra, V.K.）、威尔逊（Wilson, S.H.）。提交日期：2018年11月14日；发布日期：2019年3月27日；最后修改日期：2023年10月11日。实验方法：X射线衍射（X-RAY DIFFRACTION），分辨率2.457埃（Å）。引用文献：《DNA聚合酶β精准复制5-甲基胞嘧啶及其氧化形式的分子机制》，刊载于《Journal of Biological Chemistry（简称J.Biol.Chem.）》2019年第294卷。