Cohorte familiale d'asthme du Saguenay-Lac-Saint-Jean (SLSJ asthma family cohort) - données génétiques de la puce de génotypage Omni2.5 (genetic data from Omni2.5 chip)

La cohorte familiale d'asthme du Saguenay-Lac-Saint-Jean est une cohorte créée en 1997 et maintenue par la professeure Catherine Laprise afin de récolter des données de santé générale, cliniques et génétiques (génome, épigénome et transcriptome) pour l'étude des facteurs génétiques et environnementaux de risque et de protection de l'asthme. Cette cohorte inclus 1 394 individus répartis à travers 271 familles.

Les données génétiques de cet ensemble ont été générées dans le cadre d'une collaboration avec le professeur Damian Labuda du Centre de recherche du Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine (CHU Saint-Justine) et la professeure Hélène Vézina de l'Université du Québec à Chicoutimi (UQAC) afin de servir de données de référence pour la région du Saguenay-Lac-Saint-Jean.

Les données ont été générées pour 235 individus non apparentés de la cohorte familiale d'asthme du Saguenay-Lac-Saint-Jean avec la puce Illumina Omni2.5. Les critères d'inclusions pour la sélection de ces 235 individus étaient d'être âgé de plus de 18 ans et d'avoir ses quatre grands-parents natifs de la région.

Fichiers génétiques de format PLINK (bed, bim, fam).
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The Saguenay-Lac-Saint-Jean asthma family cohort is a cohort created in 1997 and maintained by Professor Catherine Laprise to collect general health, clinical and genetic (genome, epigenome and transcriptome) data for the study of genetic and environmental risk and protective factors for asthma. The cohort included 1,394 individuals from 271 families.

Genetic data from this set were generated in collaboration with Professor Damian Labuda of the Centre de recherche du Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine (CHU Saint-Justine) and Professor Hélène Vézina of the Université du Québec à Chicoutimi (UQAC), to serve as reference data for the Saguenay-Lac-Saint-Jean region.

Data were generated for 235 unrelated individuals from the Saguenay-Lac-Saint-Jean asthma family cohort using the Illumina Omni2.5 chip. The inclusion criteria for these 235 individuals were to be over 18 years of age and to have all four grandparents native to the region.

Genetic files in PLINK format (bed, bim, fam).