马尾松相关抗性基因序列
收藏国家林业和草原科学数据中心2022-11-01 更新2024-03-06 收录
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资源简介：
实验室提取马尾松样本RNA，分别用NanoDrop、Qubit和琼脂糖凝胶电泳等方法检测其浓度和质量，委托上海凌恩生物科技有限公司测序，得到准确碱基序列，基于Nr、COG 、GO（Gene Ontology, http://www.geneontology.org/）、KEGG（Kyoto encyclopedia of genes and genomes）等公共数据库进行基因功能注释。富集分析使用软件Goatools（https://github.com/tanghaibao/Goatools）和KOBAS（http://kobas.cbi.pku.edu. cn/ home.Do），并采用Fisher方法进行精确检验。同时采用Bonferroni、Holm、Sidak 和false discovery rate等4种多重检验方法对p值进行校正，以控制计算的假阳性率。 数据包括：马尾松GD5 解毒基因TRINITY_DN36781_c0_g1和TRINITY_DN62269_c2_g4基因序列。
提供机构：
国家林业和草原科学数据中心
创建时间：
2022-11-01
