肾癌数据分析
收藏上海数据交易所2024-07-23 更新2024-12-16 收录
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https://nidts.chinadep.com/ep-hall/spec?id=5222&from=ep-hall-diseases
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资源简介:
肾细胞癌(简称肾癌)是泌尿系统中恶性度较高的肿瘤。本产品提供DNA、RNA的分析流程以及单细胞的分析流程。其中DNA包含点突变、结构变异、融合分析、CNV变异分析。RNAseq除了基因表达差异外,还包括新转录本发现、等位基因特异性表达、转录本和非编码RNA的相互作用。单细胞分析包括细胞类别鉴定、细胞间通讯、单细胞轨迹分析、转录因子的分析。
Renal cell carcinoma (RCC, commonly referred to as kidney cancer) is a highly malignant tumor in the urinary system. This product provides analytical pipelines for DNA, RNA and single-cell samples. Specifically, the DNA analysis pipeline covers point mutations, structural variations, fusion gene detection, and copy number variation (CNV) analysis. For RNA sequencing (RNA-seq) analysis, in addition to differential gene expression analysis, it also includes de novo transcript discovery, allele-specific expression analysis, and the interaction between transcripts and non-coding RNAs. The single-cell analysis pipeline covers cell type identification, intercellular communication analysis, single-cell trajectory inference, and transcription factor analysis.
提供机构:
上海芯超数据科技有限公司
创建时间:
2024-07-23
搜集汇总
数据集介绍

背景与挑战
背景概述
该数据集名为'肾癌数据分析',专注于肾细胞癌的DNA、RNA和单细胞分析,提供包括点突变、结构变异、融合分析等多种分析流程。数据集由上海芯超数据科技有限公司提供,每月更新,覆盖全球范围,存储大小为5GB。
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