Cryo-EM map of PEDV (Pintung 52) S protein with all three protomers in the D0-down conformation determined in situ on intact viral particles.

Cryo-EM map of PEDV (Pintung 52) S protein with all three protomers in the D0-down conformation determined in situ on intact viral particles. Descriptor: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, ... Authors: Hsu, S.T.D, Draczkowski, P, Wang, Y.S. Deposit date: 2021-12-02 Release date: 2022-08-03 Last modified: 2024-10-16 Method: ELECTRON MICROSCOPY (4.7 Å) Cite: In situ structure and dynamics of an alphacoronavirus spike protein by cryo-ET and cryo-EM. Nat Commun, 13, 2022

本数据集为猪流行性腹泻病毒（Porcine Epidemic Diarrhea Virus, PEDV）Pintung 52株刺突蛋白（spike protein, S蛋白）的冷冻电镜（Cryo-Electron Microscopy, Cryo-EM）密度图，其三个原聚体（protomers）均处于D0-down构象，且是在完整病毒颗粒上原位解析得到的。
修饰成分描述：2-乙酰胺基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖、2-乙酰胺基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖-(1-4)-2-乙酰胺基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖、2-乙酰胺基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖-(1-4)-[α-L-吡喃岩藻糖-(1-6)]2-乙酰胺基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖等。
作者：Hsu, S.T.D、Draczkowski, P、Wang, Y.S.
提交日期：2021年12月2日
发布日期：2022年8月3日
最后更新日期：2024年10月16日
解析方法：冷冻电子显微镜（分辨率4.7埃）
引用文献：《基于冷冻电子断层扫描与冷冻电镜解析α冠状病毒刺突蛋白的原位结构与动态》，《自然-通讯》（*Nature Communications*），第13卷，2022年