mirex

The mirEX 2.0 web portal (http://www.combio.pl/mirex) provides a comprehensive platform for the exploration of microRNA expression data based on quantitative Real Time PCR and NGS sequencing experiments, covering various developmental stages, from wild-type to mutant plants. The portal includes mature and pri-miRNA expression levels detected in three plant species (Arabidopsis thaliana, Hordeum vulgare and Pellia endiviifolia), and in A. thaliana miRNA biogenesis pathway mutants.mirEX 2.0 网络门户（mirEX 2.0 web portal，访问网址：http://www.combio.pl/mirex）提供了一个综合性平台，用于开展基于定量实时聚合酶链反应（quantitative Real Time PCR）与下一代测序（NGS）实验的微小RNA（microRNA）表达数据挖掘。该平台覆盖从野生型到突变体植株的不同发育阶段，收录了在3种植物——拟南芥（Arabidopsis thaliana）、大麦（Hordeum vulgare）和带叶苔（Pellia endiviifolia）——以及拟南芥miRNA生物合成通路突变体中检测得到的成熟微小RNA（mature microRNA）与初级微小RNA（pri-miRNA）的表达水平数据。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

mirEX 2.0是一个综合性平台，用于比较分析植物初级microRNA的表达数据，基于qPCR和NGS测序实验。它覆盖了三种植物物种（拟南芥、大麦和叶苔）的成熟及pri-miRNA表达水平，包括野生型和突变体，支持用户进行跨物种、阶段和突变体的表达浏览与可视化。