2020-World-基因组数据资源系统

基因组数据库（Genome Warehouse, GWH）是存储多物种基因组拼接数据并允许公开访问的资源库，它提供基因组数据的汇交、存储、发布和共享等一系列web服务。作为国家生物信息中心（CNCB）、国家基因组科学数据中心（NGDC）的一个核心资源，GWH接受不同组装级别的完整基因组和部分基因组（叶绿体基因组、线粒体基因组、质粒基因组）序列的汇交，以及对已有基因组拼接数据的更新。对于每一个基因组拼接，除了基因组序列和注释外，GWH还收集详细的基因组相关的元数据（包括生物项目、生物样本和基因组拼接的元数据）。GWH配套了一个统一且标准化的质量控制流程，用于归档高质量的序列和注释。GWH除了提供浏览、检索等基本功能外，同时已发布的基因组序列和注释数据可以通过JBrowse进行可视化。截至2021年5月21日，GWH已经收到了用户直接汇交的19, 124个基因组拼接数据，涵盖1108个物种，并且已经发布了其中的8772个拼接数据。综上所述，GWH是一个管理大规模基因组数据的重要资源，并面向全球科研人员提供免费、可公开获取的基因组数据。GWH可以通过https://ngdc.cncb.ac.cn/gwh公开访问。