Escherichia coli strain:bacillus Genome sequencing. Escherichia coli strain:bacillus

NIAID Data Ecosystem2026-03-09 收录

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https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA352847

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environmental samples

创建时间：

2016-11-08

EMDS-6

EMDS-6是由东北大学开发的环境微生物图像数据集第六版，包含21种类型的微生物，共计1680张图像，每种微生物包含40张原始图像和40张地面实况（GT）图像。该数据集通过户外样本收集，并经过实验室观察和处理，以确保图像质量。EMDS-6特别之处在于每张图像都有对应的GT图像，这在许多环境微生物图像数据集中并不常见。数据集主要用于支持图像分析和处理相关的研究，特别是在图像去噪、分割、特征提取、分类

arXiv2022-04-25 更新2520

EMDS-5

EMDS-5是由东北大学开发的环境微生物图像数据集，包含21种微生物的1260张图像，每种微生物有20张原始图像、20张单对象GT图像和20张多对象GT图像。数据集主要用于评估图像预处理、分割、特征提取、分类和检索等功能。创建过程中，研究人员手动标注了像素级别的GT图像，确保了数据集的高质量。该数据集广泛应用于环境微生物的研究，特别是在图像分析技术的发展中，为提高微生物分类和识别的准确性提供了重要

arXiv2021-02-20 更新880

pp-contigs dataset from publication " From sewage to genomes: expanding our understanding of the urban and semi-urban wastewater RNA virome"

pp-contigs dataset from publication " From sewage to genomes: expanding our understanding of the urban and semi-urban wastewater RNA virome".

DataCite Commons2025-05-01 更新660

EMDS-7

EMDS-7是由东北大学创建的环境微生物图像数据集，包含2365张原始环境微生物图像及其对应的XML格式标注文件。该数据集涵盖41种环境微生物，共标注了13216个对象，主要用于多目标检测评估。数据来源于2018至2019年间，东北大学的环境生物学家在东北中国不同湖泊和河流使用400倍光学显微镜拍摄的图像。随后，生物信息科学家于2020至2021年间手动准备了标注文件。EMDS-7数据集的应用领域

arXiv2021-10-28 更新1401

unclassified bacteria

The range of data encompasses taxonomy, morphology, physiology, sampling and concomitant environmental conditions as well as molecular biology.

DataCite Commons2020-09-19 更新710