bigbio/chem_dis_gene

这是ChemDisGene数据集的公开版本，该数据集收集了生物医学研究摘要，这些摘要标注了化学物质、疾病和基因/基因产物实体，以及这些实体之间的成对关系。

原始信息汇总

数据集概述

• 名称: ChemDisGene
• 语言: 英语
• 许可证: CC0
• 多语言性: 单语种
• 主页: https://github.com/chanzuckerberg/ChemDisGene
• 是否公开: 是
• 是否可在PubMed上访问: 是
• 任务:
  • 关系抽取 (RELATION_EXTRACTION)
  • 命名实体识别 (NAMED_ENTITY_RECOGNITION)

数据集内容

ChemDisGene是一个公开的数据集，包含生物医学研究摘要，这些摘要被标注了化学、疾病和基因/基因产品实体，以及这些实体之间的成对关系。

引用信息

@InProceedings{zhang-etal:2022:LREC, author = {Dongxu Zhang and Sunil Mohan and Michaela Torkar and Andrew McCallum}, title = {A Distant Supervision Corpus for Extracting Biomedical Relationships Between Chemicals, Diseases and Genes}, booktitle = {Proceedings of The 13th Language Resources and Evaluation Conference}, month = {June}, year = {2022}, address = {Marseille, France}, publisher = {European Language Resources Association}, }

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ChemDisGene数据集是一个包含生物医学研究摘要的集合，标注了化学物质、疾病和基因/基因产物实体及其关系。该数据集需要安装bioc依赖库才能使用，适用于关系抽取、命名实体识别和命名实体规范化等任务。