pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6)

pVHL:EloB:EloC in complex with (2S,4R)-1-((S)-2-(cyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (ligand 6) Descriptor: (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-(cyclopropylcarbonylamino)-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide, Elongin-B, Elongin-C, ... Authors: Gadd, M.S, Soares, P, Galdeano, C, Ciulli, A. Deposit date: 2017-05-04 Release date: 2017-09-20 Last modified: 2024-11-13 Method: X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) Cite: Group-Based Optimization of Potent and Cell-Active Inhibitors of the von Hippel-Lindau (VHL) E3 Ubiquitin Ligase: Structure-Activity Relationships Leading to the Chemical Probe (2S,4R)-1-((S)-2-(1-Cyanocyclopropanecarboxamido)-3,3-dimethylbutanoyl)-4-hydroxy-N-(4-(4-methylthiazol-5-yl)benzyl)pyrrolidine-2-carboxamide (VH298). J. Med. Chem., 61, 2018

本数据集记录了pVHL-延长因子B（Elongin B）-延长因子C（Elongin C）与配体6，即(2S,4R)-1-((S)-2-(环丙烷甲酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺形成的复合物的相关结构信息。
结构描述：(2S,4R)-1-[(2S)-2-(环丙基羰基氨基)-3,3-二甲基丁酰基]-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]-4-羟基吡咯烷-2-甲酰胺，涉及延长因子B（Elongin B）、延长因子C（Elongin C）等组分。
作者：Gadd, M.S.、Soares, P.、Galdeano, C.、Ciulli, A.
沉积日期：2017-05-04
发布日期：2017-09-20
最后修改日期：2024-11-13
实验方法：X射线衍射（分辨率2.2 Å）
引用文献：《基于基团优化的强效且具有细胞活性的希佩尔-林道（von Hippel-Lindau, VHL）E3泛素连接酶抑制剂：导向化学探针(2S,4R)-1-((S)-2-(1-氰基环丙烷甲酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺（VH298）的构效关系》，《药物化学杂志（J. Med. Chem.）》，2018年，第61卷。