Azoarcus networks in droplets - Random trajectories

Figshare2020-09-15 更新2026-04-08 收录

微生物空间模拟

计算生物物理

数据链接：

https://figshare.com/articles/dataset/Azoarcus_networks_in_droplets_-_Random_trajectories/12867053/1 数据链接链接失效反馈

官方服务：

资源简介：

Results of simulations used for Fig 4e-g.

创建时间：

2020-09-15

compsciencelab/mdCATH

分子动力学

计算生物物理

mdCATH数据集包含5,398个CATH域的全原子系统，使用最先进的经典力场建模，并在五个温度（从320 K到450 K）下进行五次模拟。数据集的大小包括134,950条轨迹、62.6毫秒的总采样时间、11,671,592个原子、740,813个氨基酸、464纳秒的平均轨迹长度、2,162个原子的平均系统大小、137个氨基酸的平均域长度以及3.3 TB的总文件大小。

Hugging Face2024-11-30 更新560

Nanosecond_Based单链核酸纳秒链动力学研究模型与代码数据

分子动力学模拟

计算生物物理

本数据集包含单链核酸（如dTab19、dA19、dC19、dT19、rA19、rC19、rU19）的纳秒链动力学研究相关文件，涵盖片段库、HCG模型、距离分布数据及BioEn重加权Fortran代码，支持核酸分子动力学模拟与分析。

海数据40

Computational data for the DFT and MD analyses of the solution conformation of Lanzhou lily polysaccharide (LDP)

多糖构象模拟

计算生物物理

This dataset provides the computational data underlying the DFT and MD analyses of LDP conformation in aqueous solution. It includes DFT input/output files, optimized structural files, and AIM-related

NIAID Data Ecosystem30

Text S1 - In-silico Assessment of Protein-Protein Electron Transfer. A Case Study: Cytochrome c Peroxidase – Cytochrome c

蛋白质分子模拟

计算生物物理

Supporting information on preparation of the CcP/Cytc complex, MD simulation on the CcP/Cytc complex, QM/MM e-Pathway and ET parameters. (DOCX)

NIAID Data Ecosystem80

Cellular protein delivery through membrane potential driven water pores: Computational data

计算生物物理

膜蛋白运输

Dataset molecular dynamics performed in "Cellular protein delivery through membrane potential driven water pores"

Zenodo2026-04-28 更新40