Dusko Rumen metagenomics

本项目首先采集10例牛瘤胃样本（法国INRA）进行高深度shotgun 宏基因组测序，组装构建牛瘤胃基因集；并完成对基因进行结构和功能注释；比较了牛瘤胃与、人、猪、小鼠肠道基因集在结构和功能上的异同。对另外77例包含4种饮食类别的牛瘤胃样本，进行常规深度测序，基于上述基因集，组装得到324个metagenomic assemblies；基于基因集和组装物种，对不同饮食下牛瘤胃微生态在结构、功能的异同进行了比较和阐述。