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ConSurfDB

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知名数据库2026-06-11 收录
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资源简介:

ConSurf-DB provides evolutionary conservation profiles for proteins of known structure in the PDB. Amino acid sequences similar to each sequence in the PDB were collected and multiply aligned using CSI-BLAST and MAFFT, respectively.

ConSurf-DB 为蛋白质数据库(Protein Data Bank, PDB)中已知结构的蛋白质提供进化保守性谱。针对PDB中的每条序列,研究人员收集了与其相似的氨基酸序列,并分别使用CSI-BLAST与MAFFT完成多序列比对。

提供机构:
特拉维夫大学
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背景与挑战
背景概述
ConSurfDB数据库为PDB中已知结构的蛋白质提供进化保守性分析图谱。它通过CSI-BLAST和MAFFT工具收集并多重比对与PDB序列相似的氨基酸序列。
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