Structure of the SARS-CoV-2 Spike trimer with one RBD down in complex with the Fab fragment of human neutralizing antibody clone 6

Structure of the SARS-CoV-2 Spike trimer with one RBD down in complex with the Fab fragment of human neutralizing antibody clone 6 Descriptor: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose, ... Authors: Hu, Y, Xiong, Y. Deposit date: 2021-05-15 Release date: 2022-03-16 Last modified: 2025-06-04 Method: ELECTRON MICROSCOPY (3.42 Å) Cite: Monospecific and bispecific monoclonal SARS-CoV-2 neutralizing antibodies that maintain potency against B.1.617. Nat Commun, 13, 2022

本数据集为结合人类中和抗体克隆6号的Fab片段（Fragment antigen binding, Fab）、带有一个处于向下构象的受体结合域（Receptor Binding Domain, RBD）的严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）刺突蛋白三聚体的结构。
修饰基团描述：2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖、2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖-(1→3)-2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖、2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖-(1→4)-2-乙酰氨基-2-脱氧-β-D-吡喃葡萄糖等。
作者：Hu, Y（胡毅）、Xiong, Y（熊毅）
提交日期：2021年5月15日
发布日期：2022年3月16日
最后修改日期：2025年6月4日
实验方法：电子显微镜（分辨率3.42 Å）
引用文献：《可维持对B.1.617毒株效力的单特异性及双特异性单克隆严重急性呼吸综合征冠状病毒2中和抗体》，《自然-通讯》（*Nature Communications*），第13卷，2022年