Extracellular Matrix Interaction Database

MatrixDB stores experimental data established by full-length proteins, matricryptins, glycosaminoglycans, lipids and cations. MatrixDB reports interactions with individual polypeptide chains or with multimers (e.g. collagens, laminins, thrombospondins) when appropriate. Multimers are treated as permanent complexes, referencing EBI identifiers when possible. Human interactions were inferred from non-human homologous interactions when available.

基质数据库（MatrixDB）存储了由全长蛋白质、基质隐肽（matricryptins）、糖胺聚糖（glycosaminoglycans）、脂质（lipids）及阳离子（cations）所产生的实验数据。MatrixDB可在适当时机报告其与单个多肽链或多聚体（如胶原蛋白、层粘连蛋白、血小板反应蛋白）的相互作用。多聚体被视作永久性复合物，将尽可能引用欧洲生物信息研究所（EBI，European Bioinformatics Institute）的标识符。当存在可用数据时，人类的相互作用可通过非人类同源相互作用推导获得。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

MatrixDB是一个专注于细胞外基质蛋白质、蛋白聚糖和糖胺聚糖相互作用的数据库，作为国际分子交换联盟的成员，它提供实验支持的二元相互作用数据，涵盖多种生物分子类型。该数据库支持构建和导出相互作用网络，数据整合自UniProtKB、ChEBI等权威来源。