Analyses de communautés bactériennes sur des microplastiques collectés en rade de Brest

A partir d’échantillons collectés dans le cadre de la thèse de Laura Frère soutenue en 2017 vouée à une première cartographie de la contamination en microplastiques en rade de Brest, ce projet a réalisé l’analyse des espèces colonisatrices de ces microplastiques collectés montrant que les microplastiques sont un substrat anthropogénique support d’assemblages bactériens spécifiques.Les échantillonnages correspondent à des traits de filet Manta (complétés par des prélèvements d’eau environnante) réalisés à deux temps, les 21 octobre 2015 et 9 décembre 2015, et dans deux sites de la rade de Brest, proche de la marina récréative correspondant à une zone soumise à fortes activités anthropiques, et en centre de la baie dans un zone caractérisée par l’existence d'un vortex temporaire créé par le courant de surface à marée montante concentrant les débris flottants provenant du nord et du sud de la baie (Frère et al., 2017). Au sein de chaque échantillon, les particules ont été analysées par spectroscopie Raman permettant de discriminer le type de polymère et la taille (Frère, 2017). Les microplastiques ont été poolés en fonction de la zone et du temps de prélèvement, du polymère (polyéthylène (PE), polypropylène (PP) et polystyrène (PS)) et la classe de taille (0,3-1 vs. 1-2 vs. 2-5mm), soit 47 échantillons de microplas tiques et 12 échantillons d’eau de mer filtrée qui ont été étudiés pour leurs assemblages bactériens par séquençage de l'amplicon 16S.