Genomics of Olea europaea cultivars

The files in this collection are supplemental information for the research article "Genomics of Olea europaea cultivars and the questionable nature of PCR marker counts", Richard B. Frost, 2023. Further inquiries can be directed to https://frostconcepts.org/. CONTENT SIZES Ax~=b.zip 8.7 GB Farga FNA Chromosome Data.zip 141.2 MB Farga MX Chromosome Data.zip 275.5 MB Farga TXT Chromosome Data.zip 275.4 MB Koehmstedt Data.zip 483.8 KB Mathematica.zip 429.5 MB Merged Data.zip 19.7 KB Primer Correlations.zip 12.2 GB Primer Displacements.zip 17.2 KB Primer Forms.zip 126.4 MB Primer Locations.zip 1.3 GB Primer Properties.zip 8.6 GB Profile Data.zip 90 KB Profile Distances.zip 369.1 KB Raw Accession Data.zip 1.7 MB README.txt 3.2 KB SSR Motifs.zip 7.1 GB ----------------------------- -------- Total 39.1 GB CONTENT FILE TYPES .zip zipped folders created by 7-Zip File Manager .gz GNU compressed files, can be uncompressed by 7-Zip .csv comma separated values file of tabular data .fna FASTA format chromosome sequence .pdf Adobe PDF .tsv tab separated values file of tabular data .txt ASCII text .xlsx MS Excel worksheet .m auto-generated Mathematica package file .mx can only be read by Mathematica v.12 or greater on Intel i9 platform .nb Mathematica notebook files requiring v.12 or greater Note 1: several tabular files are too large for input to standard spreadsheet programs. Note 2: nearly all .mx files have been converted to .tsv files for generic distribution. Note 3: tabular data files can contain cells with multi-dimension data, delimited by "{", ",", and "}" characters. Further parsing of these files will be necessary to use them in 3rd party software. Note 4: the directory organization for this software is specified in "0000 Olive package". Note 5: origin of a specific file can usually be found with program "0100 Notebook Text Finder". Note 6: novice users of Mathematica should not attempt to modify .nb files. CONTENT ASSOCIATIONS Folder Article section(s) ----------------------------- ----------- Koehmstedt Data.zip 1 Raw Accession Data.zip 4.2.a Profile Data.zip 4.2.b Merged Data.zip 4.2.c Profile Distances.zip 4.3 Farga FNA Chromosome Data.zip 4.5 Farga MX Chromosome Data.zip 4.5 Farga TXT Chromosome Data.zip 4.5 SSR Motifs.zip 4.6 Primer Properties.zip 4.7 Primer Correlations.zip 4.8.1 Primer Locations.zip 4.8.1 Primer Forms.zip 4.8.2.a Ax~=b.zip 4.8.2.c Primer Displacements.zip n/a Mathematica.zip source code本合集内的所有文件均为研究论文《油橄榄（Olea europaea）栽培品种基因组学与聚合酶链式反应（Polymerase Chain Reaction，简称PCR）标记计数的可疑性质》（作者Richard B. Frost，2023年）的补充资料。如有进一步咨询，可通过https://frostconcepts.org/联系。 ### 内容大小 Ax~=b.zip：约8.7 GB Farga FNA Chromosome Data.zip：141.2 MB Farga MX Chromosome Data.zip：275.5 MB Farga TXT Chromosome Data.zip：275.4 MB Koehmstedt Data.zip：483.8 KB Mathematica.zip：429.5 MB Merged Data.zip：19.7 KB Primer Correlations.zip：12.2 GB Primer Displacements.zip：17.2 KB Primer Forms.zip：126.4 MB Primer Locations.zip：1.3 GB Primer Properties.zip：8.6 GB Profile Data.zip：90 KB Profile Distances.zip：369.1 KB Raw Accession Data.zip：1.7 MB README.txt：3.2 KB SSR Motifs.zip：7.1 GB ----------------------------- 总计：39.1 GB ### 内容文件类型 .zip：由7-Zip File Manager创建的压缩文件夹 .gz：GNU压缩文件，可通过7-Zip解压 .csv：逗号分隔值格式的表格数据文件 .fna：FASTA格式的染色体序列文件 .pdf：Adobe可移植文档格式（PDF）文件 .tsv：制表符分隔值格式的表格数据文件 .txt：ASCII文本文件 .xlsx：Microsoft Excel工作表文件 .m：自动生成的Mathematica软件包文件 .mx：仅可在Intel i9平台上使用Mathematica v12及更高版本读取的文件 .nb：需使用Mathematica v12及更高版本打开的Mathematica笔记本文件 ### 注意事项 注意1：部分表格文件体积过大，无法在标准电子表格软件中导入。 注意2：几乎所有.mx文件均已转换为.tsv文件，以实现通用分发。 注意3：表格数据文件可能包含以“{”、“,”、“}”字符分隔的多维数据单元格，需对这些文件进行进一步解析后方可在第三方软件中使用。 注意4：本数据集的目录结构已在"0000 Olive package"中指定。 注意5：特定文件的来源通常可通过程序"0100 Notebook Text Finder"查询。 注意6：Mathematica新手用户请勿尝试修改.nb格式文件。 ### 内容关联 | 压缩包文件 | 对应文章章节 | | --- | --- | | Koehmstedt Data.zip | 1 | | Raw Accession Data.zip | 4.2.a | | Profile Data.zip | 4.2.b | | Merged Data.zip | 4.2.c | | Profile Distances.zip | 4.3 | | Farga FNA Chromosome Data.zip | 4.5 | | Farga MX Chromosome Data.zip | 4.5 | | Farga TXT Chromosome Data.zip | 4.5 | | SSR Motifs.zip | 4.6 | | Primer Properties.zip | 4.7 | | Primer Correlations.zip | 4.8.1 | | Primer Locations.zip | 4.8.1 | | Primer Forms.zip | 4.8.2.a | | Ax~=b.zip | 4.8.2.c | | Primer Displacements.zip | 不适用（n/a） | | Mathematica.zip | 源代码