Transcriptome data for the embryogenic callus formation in Bambusa changningensis

以 Bambusa changningensis Yi et B. X. Li 的芽作为外植体诱导愈伤组织形成。为分析不同发育阶段调控愈伤组织诱导的基因表达水平，我们从胚性愈伤组织 （EC） 与非胚性愈伤组织 （NE）、ECX vs NEX 和 ECP 与 NEP 中提取 mRNA 进行 Illumina 测序，共获得 62.08 Gb 的干净数据。每个样品包含 6.16 Gb 的干净数据，质量分数高于 30 （Q30） 的百分比超过 92.92%。与指定的参考基因组相比，通过对每个样本的干净读数进行测序，比对效率在 78.25% 至 81.36% 之间。ECX 与 NEX 共获得 4332 个 DEGs，其中 2846 个基因上调，1486 个基因下调。在 EC 与 NE 中发现了 4264 个 DEGs，其中 2408 个上调和 1856 个 DEGs下调。而在 ECP 和 NEP 中获得 7679 个 DEGs，后者有 4658 个上调基因和 3021 个下调基因。这些结果表明，NE 和 EC 不同发育阶段的基因表达水平存在显著差异。