cigar macrobiotics

原始数据为 Illumina fastq 格式，首先对原始数据进行切分、质量切割等操作，如果是宿主体内或宿主表面的微生物，则同时进行宿主污染等操作。获得的序列为有效数据，使用剪接软件进行剪接组装，并进行基因预测。对预测基因进行注释和分类，包括NR、KEGG、eggNOG等。同时，获得每个样品中物种的相对丰度，并在此基础上进行样品相似性聚类、测序检验和差异统计比较。