Datasets exploring putative lncRNA-miRNA-mRNA axes in breast cancer cell lines

Data accompanied with the paper "Datasets exploring putative lncRNA-miRNA-mRNA axes in breast cancer cell lines" by Wasson et al. in Data in Brief. Please refer to this article for full project details. The data consists of : * .txt files containing predicted lncRNA/miRNA/mRNA axis for four long non-coding RNAs (LincIN, SPRY4-IT1, AC009283.1, LincK) * .R script we used to generate predicted lncRNA/miRNA/mRNA microarray data obtained from GEO datasets (GSE79214, GSE62507, GSE134254, GSE109007)本数据集配套Wasson等人发表于《Data in Brief》期刊的论文《探索乳腺癌细胞系中推定的长链非编码RNA-微小RNA-信使RNA调控轴的数据集》（Datasets exploring putative lncRNA-miRNA-mRNA axes in breast cancer cell lines）。请参阅该论文以获取本项目的完整细节。本数据集包含以下内容： • 多份.txt格式文件，内含针对4种长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）——LincIN、SPRY4-IT1、AC009283.1、LincK的推定lncRNA-微小RNA（microRNA, miRNA）-信使RNA（messenger RNA, mRNA）调控轴的预测结果； • 用于生成从基因表达综合数据库（Gene Expression Omnibus, GEO）数据集（GSE79214、GSE62507、GSE134254、GSE109007）获取的lncRNA-miRNA-mRNA基因微阵列预测数据的R脚本文件。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集聚焦于乳腺癌细胞系，旨在探索潜在的lncRNA-miRNA-mRNA调控轴。它包含针对四个长非编码RNA（LincIN、SPRY4-IT1、AC009283.1、LincK）的预测轴文本文件，以及用于数据生成的R脚本，数据源自GEO数据库的多个微阵列数据集，支持生物信息学分析和研究复现。