final_soap_calo2
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Assembly of Caloptilia triadicae from Genbank SRA accession #SRR1794032, using multiple kmers (13,23,33,43,63) with SOAPdenovo-Trans v1.01. Different Kmer assemblies were combined with cd-hit-est and processed with the fastx toolkit. See Breinholt et al. (2017) for more details.
本数据集为三叶细蛾(Caloptilia triadicae)的转录组组装数据,其原始测序数据源自GenBank序列读取存档(Sequence Read Archive, SRA)编号SRR1794032。组装过程采用13、23、33、43、63共5种不同k值,并使用SOAPdenovo-Trans v1.01软件完成。随后通过cd-hit-est软件对不同k值得到的组装结果进行合并,并借助FASTX工具包(FASTX Toolkit)完成后续数据处理。详细信息请参见布赖因霍尔特等人(Breinholt et al., 2017)的相关研究。
创建时间:
2017-05-18



