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Descritores físico-químicos e estruturais das proteínas contendo sítios alostéricos.

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DataCite Commons2023-11-07 更新2024-07-13 收录
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https://www.redape.dados.embrapa.br/citation?persistentId=doi:10.48432/FBJUQA
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O banco de dados de sítios alostéricos foi construído a partir lista de arquivos descarregada do site da base de dados ASD (AlloSteric Database), disponível em https://mdl.shsmu.edu.cn/ASD/, contendo informações sobre as proteínas com sítios alostéricos. Usando essa lista, buscamos no PDB as proteínas cujas estruturas têm resolução melhor que 2.5 Å. Essa filtragem resultou em 7684 estruturas, e para cada uma delas foram calculados os descritores físico-químicos e estruturais da plataforma STING, distribuídos em 108 tabelas do banco de dados relacional. O objetivo desse conjunto de dados é identificar, baseado nesses descritores, os resíduos de aminoácidos pertencentes ao sítio alostérico dessas proteínas. Essa informação é importante, uma vez que a alosteria é pertinente para regular a atividade funcional de uma proteína induzida pela ação de um efetor em um sítio distinto do sítio ativo de biomoléculas através de alteração de conformação e/ou dinâmica. Os dados estão disponibilizados no formato CSV. O usuário pode trabalhar com um conjunto de dados separado, ou pode unir os arquivos. Não há uma sequência lógica para ele fazer isso, pode seguir a ordem alfabética, se quiser.
提供机构:
Redape
创建时间:
2023-08-07
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