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Dataset 7.8 Skin matrix.isoforms.TPM.not_cross_norm.TMM_info

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DataONE2018-03-01 更新2024-06-25 收录
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Dataset 7 contains the raw gene/transcript counts data for each frog tissue sample (Experiment B, n = 61) resulting from allocation of sequence reads to genes from the transcriptome assemblies. These data are contained in Dataset 7, as 12 individual tab-separated text files (.txt) [Data Citation 1]. The four files for each tissue type (skin, liver and spleen) represent raw (1) counts, (2) TMM.EXPR files, (3) TPM.not_cross_norm files, and (4) normalisation information (as per the standard output from RSEM). The first row of these files (1-3 above) represents frog ID, and the first element of all subsequent rows represents transcript/isoform ID.

数据集7包含实验B中61个青蛙组织样本的原始基因/转录本计数数据,此类数据通过将序列读数比对至转录组组装得到的基因而生成。上述数据以12个独立的制表符分隔文本文件(.txt)的形式存储于数据集7中[数据引用1]。针对皮肤、肝脏、脾脏三种组织类型,每种组织对应4个文件,分别为(1)原始计数文件、(2)TMM.EXPR文件、(3)TPM.not_cross_norm文件以及(4)归一化信息文件(格式遵循RSEM的标准输出)。上述第1至3类文件的首行代表青蛙样本ID,后续所有行的首个元素则代表转录本/异构体ID。

创建时间:
2018-03-01
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