Gurveer05/maize-nam-gene-expression-data
收藏Hugging Face2024-01-14 更新2024-03-04 收录
下载链接：
https://hf-mirror.com/datasets/Gurveer05/maize-nam-gene-expression-data
下载链接
链接失效反馈官方服务：
资源简介：
该数据集包含26个玉米NAM品系的启动子序列和对应的基因表达数据（以TPM值表示），并用于Florabert模型的微调步骤。数据集被分为训练、测试和评估数据，比例为70-20-10，总共有约700,000条数据。数据集的标签对应于不同组织的TPM值，包括花穗、基部、花药、中部、穗、芽、尖和根。使用的序列是那些至少有一个组织的TPM值大于1的玉米NAM品系基因的启动子序列。
该数据集包含26个玉米NAM品系的启动子序列和对应的基因表达数据（以TPM值表示），并用于Florabert模型的微调步骤。数据集被分为训练、测试和评估数据，比例为70-20-10，总共有约700,000条数据。数据集的标签对应于不同组织的TPM值，包括花穗、基部、花药、中部、穗、芽、尖和根。使用的序列是那些至少有一个组织的TPM值大于1的玉米NAM品系基因的启动子序列。
提供机构：
Gurveer05
原始信息汇总
玉米NAM品系的启动子序列及相应基因表达数据
数据集描述
该数据集包含26个玉米NAM品系的启动子序列及其相应的基因表达数据，以TPM值表示。这些数据已被用于Florabert模型的微调步骤，以进行下游的基因表达预测任务。
数据划分
数据被分为训练集、测试集和评估集，比例为70-20-10。总共约有700,000条记录。获取这些数据的步骤可在Github Repository中找到。
标签说明
标签对应于不同组织类型的TPM值，顺序为：
- tassel
- base
- anther
- middle
- ear
- shoot
- tip
- root
所使用的序列是至少有一个组织的TPM值大于1的玉米NAM品系基因的启动子序列。
