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MAZTER-seq数据

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国家林业和草原科学数据中心2022-12-19 更新2024-03-06 收录
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https://www.forestdata.cn/dataDetail.html?id=CSTR:17575.11.0220221219188.070001.V1
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官方服务:
资源简介:
使用DynabeadsTM mRNA purification kit (Thermo, 61006)对总RNA进行两轮纯化得到1 μg的poly(A)+ RNA。将poly(A)+ RNA进行高温处理去除RNA二级结构,接着进行MazF酶切反应,对片段化的RNA产物进行末端修复。纯化后的末端修复产物使用NEBNext small RNA测序建库试剂盒构建第二代高通量测序文库。采用150 nt双端测序模式在Illumina Novaseq 6000测序仪上测序。设置了三个重复,最终通过生物信息学分析,发现ACA motif富集于终止密码子区域,与MeRIP-seq数据相似。
提供机构:
国家林业和草原科学数据中心
创建时间:
2022-12-19
5,000+
优质数据集
54 个
任务类型
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