OpenProt

The first proteogenomic resource enforcing a polycistronic model of annotation across an exhaustive transcriptome for 10 species. OpenProt reports experimental evidence cumulated across a re-analysis of 114 mass spectrometry and 87 ribosome profiling datasets. The multi-omics OpenProt resource also includes the identification of predicted functional domains and evaluation of conservation for all predicted ORFs.首个针对10个物种全转录组、采用多顺反子注释模型的蛋白质基因组学（proteogenomic）资源。OpenProt 汇总了对114套质谱（mass spectrometry）数据集与87套核糖体图谱（ribosome profiling）数据集开展重分析所积累的实验证据。该多组学（multi-omics）OpenProt资源还涵盖了对所有预测开放阅读框（ORF）的预测功能结构域的鉴定，以及其保守性评估工作。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

OpenProt是一个多组学资源，通过放宽传统注释标准（如包括所有长度超过30个密码子的ORF、允许多个ORF per transcript等），提供了更深入的蛋白质组描述。它基于对大量公开质谱和核糖体分析数据集的重新分析，积累了实验证据，并涉及功能域预测和ORF保守性评估。