PDB: 5DK3 - Crystal Structure of Pembrolizumab, a full length IgG4 antibody, (311.5K, 38.5°C, 500 ns) - random seed #1: RMSD, SASA, RMSF, Rg

PDB: 5DK3 - Crystal Structure of Pembrolizumab, a full length IgG4 antibody, (311.5K, 38.5°C, 500 ns) - random seed #1: RMSD, SASA, RMSF, Rg

蛋白质数据库（Protein Data Bank，PDB）编号5DK3：帕博利珠单抗（Pembrolizumab）全长IgG4抗体的晶体结构，实验条件为311.5开尔文、38.5摄氏度、500纳秒——随机种子#1对应的分析指标：均方根偏差（Root Mean Square Deviation，RMSD）、溶剂可及表面积（Solvent Accessible Surface Area，SASA）、均方根涨落（Root Mean Square Fluctuation，RMSF）及回转半径（Radius of Gyration，Rg）

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集包含PDB ID为5DK3的Pembrolizumab（一种全长度IgG4抗体）的晶体结构分子动力学模拟轨迹数据，模拟条件为311.5K（38.5°C）和500纳秒，提供了RMSD、SASA、RMSF和Rg等分析参数。数据集属于ThermoPCD数据库，专注于抗体-抗原复合物在生理和发热温度下的动力学研究，适用于癌症免疫治疗和炎症领域的计算分析。