SMARTdb

SMARTdb is an integrative and user-friendly platform for exploring molecular dynamics of reproductive development, aging, and disease, which covers multi-omics, multi-species, and multi-stage data.We curated and analyzed single-cell transcriptomic and epigenomic data of over 2.0 million cells from 6 species across the entire lifespan. A series of powerful functionalities are provided, such as "Query gene expression", "DIY expression plot", "DNA methylation plot", and "Epigenome browser".SMARTdb是一款整合性突出、操作便捷的平台，用于探索生殖发育、衰老与疾病的分子动力学（molecular dynamics）。该平台涵盖多组学（multi-omics）、多物种及多阶段的组学数据。我们针对覆盖全生命周期的6个物种的逾200万个细胞的单细胞转录组（single-cell transcriptomic）与表观基因组（epigenomic）数据完成了整理与分析。平台提供了一系列功能强大的工具模块，包括"基因表达查询（Query gene expression）"、"自定义表达图谱绘制（DIY expression plot）"、"DNA甲基化图谱绘制（DNA methylation plot）"以及"表观基因组浏览器（Epigenome browser）"。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

SMARTdb是一个集成平台，专注于探索生殖医学领域的单细胞多组学数据，涵盖多物种和全生命周期。它整合了超过200万个细胞的转录组和表观基因组数据，并提供基因表达查询、自定义表达图等多种分析功能。