PANDIT
收藏知名数据库2026-06-11 收录
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PANDIT is a database of homologous sequence alignments accompanied by estimates of their corresponding phylogenetic trees.
PANDIT是一款收录同源序列比对（homologous sequence alignments）结果的数据库，并附带其对应系统发育树（phylogenetic trees）的相关估算结果。
提供机构：
欧洲生物信息学研究所搜集汇总
数据集介绍
背景与挑战
背景概述
PANDIT是一个包含多重序列比对和系统发育树的数据集，覆盖多种常见蛋白质结构域。它整合了来自Pfam-A数据库的种子蛋白序列比对、相应的核苷酸序列比对以及针对有核苷酸序列的家族成员的蛋白序列比对，并为每个比对提供了推断的系统发育树。该数据集基于版本17.0，发布于2005年，并包含基于HMM方法的比对质量评估。
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