Proteins API

The Proteins REST API provides access to key biological data from UniProt and data from Large Scale Studies (LSS) mapped to UniProt. The services provide sequence feature annotations from UniProtKB, variation data from UniProtKB and mapped from LSS (1000 Genomes, ExAC and COSMIC), proteomics data mapped from MS-proteomics repositories (PeptideAtlas, MaxQB and EPD), antigen sequences mapped from Human Protein Atlas (HPA), proteomes and taxonomy search and retrieval, and reference genome coordinate mappings.蛋白质REST API（Proteins REST API）可获取来自通用蛋白质知识库（UniProt）的核心生物学数据，以及映射至该知识库的大规模研究（Large Scale Studies, LSS）数据。该API提供的服务包括：来自UniProtKB的序列特征注释、源自UniProtKB且经1000 Genomes、ExAC与COSMIC等大规模研究映射得到的变异数据、源自质谱蛋白质组学数据库（PeptideAtlas、MaxQB及EPD）的蛋白质组学数据、源自人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas, HPA）的抗原序列，同时支持蛋白质组与生物分类学的搜索与检索，以及参考基因组坐标映射功能。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Proteins API 是一个REST API，提供来自UniProt的关键生物数据，以及从大规模研究映射到UniProt的数据。该服务涵盖序列特征注释、变异数据、蛋白质组学数据、抗原序列、蛋白质组和分类搜索，以及参考基因组坐标映射，支持多种数据格式如XML、JSON和GFF。