Molecular dynamics of LYVE-1 and CD44 in complex with hyaluronan

Input and output data for MD of mouse/human LYVE-1 and mouse CD44, both, as apo proteins (PDB code 2JCP for mCD44) and in complex with hyaluronan hexasaccharide (HA6; PDB: 2JCR for mCD44). AMBER parm7 topology (.top), restart (.rst), minimisation and MD inputs (.tin, .in), binary NETCDF trajectories (.netcdf) and volumetric maps (.dx) are shared.本数据集包含小鼠/人源淋巴管内皮细胞透明质酸受体1（LYVE-1）与小鼠分化簇44（CD44）的分子动力学（Molecular Dynamics, MD）相关输入与输出数据，两类蛋白均涵盖两种状态：无配体蛋白形式（小鼠CD44的无配体结构对应蛋白质数据库（Protein Data Bank, PDB）编号2JCP），以及与透明质酸六糖（HA6）结合的复合物形式（小鼠CD44的复合物结构对应PDB编号2JCR）。本次共享的数据文件类型包括：AMBER力场套件的parm7格式拓扑文件（.top）、重启文件（.rst）、能量最小化与分子动力学输入文件（.tin、.in）、二进制NETCDF格式轨迹文件（.netcdf）以及体网格图文件（.dx）。