构建楸树高密度基因图谱及F1群体种间的叶片性状和植株生长QTL基因定位
收藏国家林业和草原科学数据中心2022-11-01 更新2024-03-06 收录
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资源简介：
利用限制性位点相关DNA测序技术( RAD-seq )鉴定分子标记并构建遗传图谱。测序后获得了约280.77Gb的清洁数据，总共有25614295个单核苷酸多态性(SNPs)，在楸树( 7080 ) ×楸树( 16 - PJ-3 ) F1群体及其亲本的200个个体的基因组中初步鉴定出2 871 647个插入缺失( InDels )，最终获得了满足构建遗传图谱要求的9072个SNP和521个InDel标记。整合的遗传图谱包含9593个多形性标记，跨度3151.63 cm，相邻标记之间的平均距离为0.32 cm。使用我们的遗传图谱通过包含复合区间作图（ICIM）在五个连续的时间点确定了 7 个叶片性状的 20 个 QTL 和植物高度的 13 个 QTL 。Q16-60 被确定为五个叶性状的 QTL，并且至少检测到两次与植物生长相关的重要 QTL（Q9-1、Q18-66 和 Q18-73）。
提供机构：
国家林业和草原科学数据中心
创建时间：
2022-11-01
