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Bacteria_NR\Fungi_NR

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科学数据银行2025-08-01 更新2026-04-23 收录
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https://www.scidb.cn/detail?dataSetId=48fc89bc0664475899fcbb2c355885d6
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资源简介:
以下是所提供文本的英文翻译:该数据表示对 NR 数据库进行测序数据的注释结果。数据表的前八列对应于不同分类级别的物种名称。方法:使用DIAMOND软件(http://ab.inf.uni-tuebingen.de/software/diamond/)将非冗余基因集与NR数据库进行比对(比对类型:BLASTP(版本2.2.28+,http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi),BLAST比对参数期望值(e值)设置为1e-5)。通过与NR数据库关联的分类信息数据库获得物种注释结果。然后将每个物种的丰度计算为其相应基因丰度的总和。在以下分类水平上对样本的物种丰度进行了统计分析:域、界、门、纲、目、科、属和种。这个过程在各自的分类水平上产生了丰度概况。
提供机构:
Shaqian Liu
创建时间:
2025-08-01
5,000+
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54 个
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