Structure of a c-di-GMP-II riboswitch from C. acetobutylicum bound to c-di-GMP

Structure of a c-di-GMP-II riboswitch from C. acetobutylicum bound to c-di-GMP Descriptor: 9,9'-[(2R,3R,3aS,5S,7aR,9R,10R,10aS,12S,14aR)-3,5,10,12-tetrahydroxy-5,12-dioxidooctahydro-2H,7H-difuro[3,2-d:3',2'-j][1,3,7,9,2,8]tetraoxadiphosphacyclododecine-2,9-diyl]bis(2-amino-1,9-dihydro-6H-purin-6-one), MAGNESIUM ION, c-di-GMP-II riboswitch Authors: Smith, K.D, Shanahan, C.A, Moore, E.L, Simon, A.C, Strobel, S.A. Deposit date: 2010-12-22 Release date: 2011-05-11 Last modified: 2024-02-21 Method: X-RAY DIFFRACTION (2.51 Å) Cite: Structural basis of differential ligand recognition by two classes of bis-(3'-5')-cyclic dimeric guanosine monophosphate-binding riboswitches. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011

本数据集为丙酮丁醇梭菌（Clostridium acetobutylicum）来源的、与环二鸟苷酸二聚体（c-di-GMP）结合的c-di-GMP-II核糖开关（c-di-GMP-II riboswitch）的三维结构。配体描述：9,9'-[(2R,3R,3aS,5S,7aR,9R,10R,10aS,12S,14aR)-3,5,10,12-四羟基-5,12-二氧化八氢-2H,7H-二呋喃并[3,2-d:3',2'-j][1,3,7,9,2,8]四氧杂二磷杂环十二烷-2,9-二基]双(2-氨基-1,9-二氢-6H-嘌呤-6-酮)、镁离子、c-di-GMP-II核糖开关。作者：Smith, K.D.、Shanahan, C.A.、Moore, E.L.、Simon, A.C.、Strobel, S.A.。存档日期：2010-12-22；发布日期：2011-05-11；最后更新日期：2024-02-21。实验方法：X射线衍射（X-RAY DIFFRACTION），分辨率2.51埃（Å）。参考文献：《两类双-(3'-5')-环二鸟苷酸单磷酸结合核糖开关的配体差异化识别结构基础》，发表于《美国国家科学院院刊》（Proc.Natl.Acad.Sci.USA），2011年，第108卷。