HiQBind Dataset

HiQBind, a protein-ligand binding dataset that contains 18,160 unique PDB entries with binding affinity annotations, 32,275 protein-ligand complexes structures refined by HiQBind-WF workflow.hiqbind.tar.gz: Protein-Ligand complexes structures in HiQBindhiqbind_metadata.csv: Metadata for HiQBind datasethiqbind_sm_metadata.csv: Metadata for subset of HiQBind in which ligands all small moleculeshiqbind_poly_metadata.csv: Metadata for subset of HiQBind in which ligands are polyemersREADME.md: Description of the structural dataset and columns in the metadata csv file<br>

HiQBind是一款蛋白质-配体结合数据集，包含18160条带有结合亲和力注释的唯一蛋白质数据库（Protein Data Bank，PDB）条目，以及经HiQBind-WF工作流精修得到的32275个蛋白质-配体复合物结构。
hiqbind.tar.gz：存放HiQBind数据集的蛋白质-配体复合物结构文件
hiqbind_metadata.csv：HiQBind数据集的元数据文件
hiqbind_sm_metadata.csv：HiQBind子集元数据文件，该子集的配体均为小分子
hiqbind_poly_metadata.csv：HiQBind子集元数据文件，该子集的配体为聚合物
README.md：该结构数据集及元数据CSV文件各字段的说明文档

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

HiQBind Dataset是一个蛋白质-配体结合数据集，包含18,160个独特的PDB条目和32,275个经过优化的蛋白质-配体复合物结构，适用于结构生物学和计算化学研究。数据集提供结构数据、元数据文件和详细说明，支持基于结构的药物设计和机器学习应用。