泡桐全基因组重测序数据
收藏国家林业和草原科学数据中心2024-08-02 更新2024-11-16 收录
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资源简介:
采集雌亲本、雄亲本和98株F1代植株的嫩叶,采用CTAB法提取基因组DNA。经过一系列操作(如DNA片段化、末端修复、添加Poly(A)尾和适配器等)后,将合格的DNA用于构建测序文库。合格的文库基于Illumina Hiseq×10平台通过双末端PE150进行测序(Illumina, San Diego, CA, USA),测序深度为10×。
Young leaves of female parent, male parent and 98 F1 progeny plants were collected, and genomic DNA was extracted via the CTAB method. After a series of procedures including DNA fragmentation, end repair, poly(A) tail addition and adapter ligation, qualified DNA samples were used to construct sequencing libraries. Qualified libraries were sequenced using paired-end PE150 strategy on the Illumina HiSeq ×10 platform (Illumina, San Diego, CA, USA), with a sequencing depth of 10×.
提供机构:
国家林业和草原科学数据中心
创建时间:
2024-08-02
搜集汇总
数据集介绍

背景与挑战
背景概述
该数据集包含泡桐全基因组重测序数据,通过采集雌雄亲本和F1代植株样本,采用CTAB法提取DNA并在Illumina平台上进行测序,生成了高质量基因组数据。数据用于支持泡桐高密度遗传图谱构建和重要性状QTL定位研究,属于林学领域的限制共享科学数据。
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