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TARGET-seq+ transcriptome raw counts

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portal.sds.ox.ac.uk2024-06-24 更新2025-01-15 收录
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https://portal.sds.ox.ac.uk/articles/dataset/TARGET-seq_transcriptome_raw_counts/23576379/1
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资源简介:
Raw RNA counts for TARGET-seq+ single-cell whole transcriptome data from bone marrow samples from 9 cases with clonal hematopoiesis and 4 control samples. For details on cell sorting and the TARGET-seq+ protocol see the methods section of the manuscript. Cells are named with their plate and well IDs and the subject ID. Empty wells (no-cell controls) are named "blank".  Reads were mapped using the GENCODE v38 reference gene annotation with ERCC transcripts.

本数据集包含源自9例克隆性造血病例和4个对照组骨髓样本的TARGET-seq+单细胞全转录组数据的原始RNA计数。关于细胞分选和TARGET-seq+方案的具体细节,请参阅论文的方法部分。细胞名称由其板和孔ID以及受试者ID组成。空白孔(无细胞对照)命名为“空白”。序列读取采用GENCODE v38参考基因注释以及ERCC转录本进行比对。
提供机构:
University of Oxford
5,000+
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54 个
任务类型
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