chimera-bench

CHIMERA-Bench v1.0 是一个用于表位特异性抗体CDR序列-结构协同设计的统一基准数据集。该数据集包含2,922个复合物，其中2,721个具有PDB结构，2,941个预计算的特征文件（.pt格式）。数据集提供了三种分割方式（表位组、抗原折叠、时间序列），并支持IMGT和Chothia编号方案。每个复合物特征文件包含序列、坐标、注释、编号和表面特征等详细信息。数据集适用于抗体设计、蛋白质结构预测和生物分子设计等任务，并提供了11种基准方法和6种范式的评估结果。数据以PyTorch张量和PDB文件形式存储，包含元数据、分割信息和结构文件。