dbCAN

dbCAN3 server is a web server for automated Carbohydrate-active enzyme ANnotation, funded by the NSF (DBI-1933521) and NIH (R01GM140370). Similar resources on the web include CAZy, CAT (obsolete), and CUPP. dbCAN3 server can identify transcription factors (TFs), transporters (TCs), signal transduction proteins (STPs), and further CAZyme gene clusters (CGCs) using CGC-Finder if users submit faa+gff files or fna file dbCAN3 server combines the results from the three tools and allows visualization of detailed results as tables/graphs.dbCAN3 服务器是一款用于自动化碳水化合物活性酶注释（Carbohydrate-active enzyme Annotation）的Web服务平台，由美国国家科学基金会（National Science Foundation, NSF，资助编号DBI-1933521）与美国国立卫生研究院（National Institutes of Health, NIH，资助编号R01GM140370）资助。当前网络上的同类在线资源包括CAZy、CAT（已废弃）以及CUPP。dbCAN3 服务器可识别转录因子（Transcription Factors, TFs）、转运蛋白（Transporters, TCs）与信号转导蛋白（Signal Transduction Proteins, STPs）；若用户提交faa+gff格式文件或fna格式文件，还可通过CGC-Finder工具进一步识别碳水化合物活性酶基因簇（CAZyme Gene Clusters, CGCs）。dbCAN3 服务器整合了三款工具的分析结果，并支持以表格或图表形式可视化展示详细分析结果。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

dbCAN3是一个由NSF和NIH资助的Web服务器，专门用于自动化碳水化合物活性酶的注释。它整合了多种工具，能够预测CAZyme的底物、识别转录因子和转运蛋白等，并支持CAZyme基因簇的分析。此外，服务器还提供结果的可视化功能，以表格和图表形式展示详细数据。