isomiRdb

We developed isomiRdb, a comprehensive resource that compiles miRNA expression data at isomiR resolution from various sources.Our database provides online access to the 90 483 most abundant isomiRs (>1 RPM in at least 1% of the samples) from 52 tissues and 188 cell types. Additionally, the full set of over 3 million detected isomiRs is available for download.本研究构建了isomiRdb数据库，这是一款整合多来源数据、以miRNA异构体（isomiR）为分析分辨率的综合性微小RNA（miRNA）表达资源平台。该数据库支持在线获取来自52种组织与188种细胞类型的90483个丰度最高的miRNA异构体，这些异构体在至少1%的样本中reads计数大于1 RPM（每百万读段计数，Reads Per Million）。此外，所有已检测到的逾300万个miRNA异构体的完整数据集均可下载获取。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

isomiRdb是一个全面的miRNA表达数据库，专注于异构体分辨率，存储了来自多个来源的42,499个miRNA-seq样本的表达数据，覆盖超过70,000个不同的miRNA异构体。该数据库提供在线访问52个组织和188种细胞类型中最丰富的90,483个isomiRs，并允许下载超过300万个检测到的isomiRs，支持样本、miRNA和isomiR三种查询方式。