OrthoMCL-DB

The OrthoMCL database (http://orthomcl.cbil.upenn.edu) houses ortholog group predictions for 55 species, including 16 bacterial and 4 archaeal genomes representing phylogenetically diverse lineages, and most currently available complete eukaryotic genomes: 24 unikonts (12 animals, 9 fungi, microsporidium, Dictyostelium, Entamoeba), 4 plants/algae and 7 apicomplexan parasites.

OrthoMCL数据库（OrthoMCL）的官方网址为http://orthomcl.cbil.upenn.edu，该数据库收录了55个物种的直系同源组预测结果，包含16种细菌与4种古菌的基因组，覆盖系统发育多样性的演化支系，同时囊括目前已公开的绝大多数完整真核生物基因组：其中24个属于单鞭毛生物（unikonts，含12种动物、9种真菌、微孢子虫、盘基网柄菌、内阿米巴）、4种植物/藻类以及7种顶复门寄生虫。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

OrthoMCL-DB是一个存储直系同源群预测的数据库，涵盖55个物种，包括细菌、古菌和多种真核生物。它提供了广泛的物种覆盖，如动物、真菌、植物和寄生虫，用于支持直系同源分析。