HISSTA

HISSTA is a comprehensive database for archiving and analyzing in situ spatial transcriptome data at single-cell resolution from human tissues. It integrates datasets generated by MERFISH, CosMx SMI, and Xenium, offering interactive tools for cell type annotation, spatial communication, and niche analysis across 28 million cells and 112 samples.

HISSTA是一款综合性数据库，用于存档、分析源自人类组织的单细胞分辨率原位空间转录组数据。该数据库整合了由MERFISH、CosMx SMI及Xenium技术生成的多套数据集，并提供交互式分析工具，可针对2800万个细胞与112个样本开展细胞类型注释、空间通讯及微环境分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

HISSTA是一个人类原位单细胞转录组图谱数据库，涵盖16种人体组织的28,465,828个细胞，使用MERFISH、CosMx和Xenium三种空间转录组技术平台。该数据库提供细胞类型注释、空间共定位分析等高级分析工具，支持对单细胞空间转录组数据的探索和可视化。