SYSTERS, GeneNest, SpliceNest

GeneNest is a database and software package for producing and visualizing gene indices from ESTs and mRNAs. Currently, the database comprises gene indices of human, mouse, Arabidopsis thaliana and zebrafish. SpliceNest is a web-based graphical tool to explore gene structure, including alternative splicing, based on a mapping of the EST consensus sequences from GeneNest to the complete human genome.GeneNest 是一款用于从表达序列标签（Expressed Sequence Tag, EST）与信使RNA（messenger RNA, mRNA）中生成并可视化基因索引的数据库与软件包。目前，该数据库已收录人类、小鼠、拟南芥（Arabidopsis thaliana）及斑马鱼的基因索引。SpliceNest 是一款基于网页的图形化分析工具，可用于探索基因结构（涵盖可变剪接），其分析依据为将 GeneNest 中的 EST 共识序列比对至完整人类基因组所得到的映射关系。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集包含GeneNest和SpliceNest两个组件。GeneNest是一个用于从ESTs和mRNAs生成并可视化基因索引的数据库和软件包，涵盖人类、小鼠、拟南芥和斑马鱼的基因索引。SpliceNest是一个基于网络的图形工具，用于探索基因结构（包括可变剪接），基于GeneNest的EST共识序列与人类完整基因组的映射。