基于SSR分子标记构建南方型美洲黑杨初级核心种质
收藏国家林业和草原科学数据中心2022-10-27 更新2024-03-06 收录
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资源简介:
以所收集的363份美洲黑杨无性系为实验材料,利 用20对SSR引 物 扩 增 数 据,设 置10%-40%共7个取样梯度构建南方型美洲黑杨初级核心种质,并采用平均观察等位基因数(Na)等遗传参数的t检验对核心种质有效性进行确认,以初级核心种质、保留种质以及原始种质三者之间平均观察等位基因数(Na)等遗传参数的保留比例作为评价指标,结合主坐标轴分析法对初级核心种质做进一步代表性确认。结果显示(1)20对SSR引物共检测到278个多态位点,遗传多样性参数I、H 分别为1.667和0.6882,表明南方型美洲黑杨种质资源具有丰富的遗传变异。(2)比较平均 Na、I、H 变化确定15%为最佳取样比例,得到54份核心种质和309份保留种质,构建的初级核心种质与原始种质的平均 Na、I、H 经t检验不显着,除平均 Na外其他平均遗传多样性参数,如 Ne、Ho、I、H 的保留率分别为111%、105%、104%和104%。(3)PCoA分析显示,所构建的初级核心种质不仅与原始种质分布相似,而且分散均匀覆盖较全面,可以代表原始种质在图中的几何分布。
提供机构:
国家林业和草原科学数据中心
创建时间:
2022-10-27



