antiSMASH v7.1.0 Database (UNOFFICIAL MIRROR)

Unofficial mirror for antiSMASH v7.1.0: https://academic.oup.com/nar/article/51/W1/W46/7151336 Kai Blin, Simon Shaw, Hannah E Augustijn, Zachary L Reitz, Friederike Biermann, Mohammad Alanjary, Artem Fetter, Barbara R Terlouw, William W Metcalf, Eric J N Helfrich, Gilles P van Wezel, Marnix H Medema, Tilmann Weber, antiSMASH 7.0: new and improved predictions for detection, regulation, chemical structures and visualisation, Nucleic Acids Research, Volume 51, Issue W1, 5 July 2023, Pages W46–W50, https://doi.org/10.1093/nar/gkad344 ``` $ tree antiSMASH/ antiSMASH/├── VERSION├── as-js│ └── 0.13│ └── antismash.js├── clusterblast│ ├── clusters.txt│ ├── proteins.dmnd│ └── proteins.fasta├── clustercompare│ └── mibig│ └── 3.1│ ├── data.json│ ├── proteins.dmnd│ └── proteins.fasta├── comparippson│ ├── asdb│ │ └── 4.0│ │ ├── cores.fa│ │ ├── cores.fa.phr│ │ ├── cores.fa.pin│ │ ├── cores.fa.psq│ │ └── metadata.json│ └── mibig│ └── 3.1│ ├── cores.fa│ ├── cores.fa.phr│ ├── cores.fa.pin│ ├── cores.fa.psq│ └── metadata.json├── download.log├── knownclusterblast│ └── 3.1│ ├── clusters.txt│ ├── proteins.dmnd│ └── proteins.fasta├── nrps_pks│ ├── stachelhaus│ │ └── 1.1│ │ └── signatures.tsv│ ├── svm│ │ └── 2.0│ │ ├── NRPS1_LARGE_CLUSTER│ │ │ ├── [asp,asn,glu,gln,aad].mdl│ │ │ ├── [cys].mdl│ │ │ ├── [dhb,sal].mdl│ │ │ ├── [gly,ala,val,leu,ile,abu,iva].mdl│ │ │ ├── [orn,lys,arg].mdl│ │ │ ├── [phe,trp,phg,tyr,bht].mdl│ │ │ ├── [pro,pip].mdl│ │ │ └── [ser,thr,dhpg,hpg].mdl│ │ ├── NRPS1_SMALL_CLUSTER│ │ │ ├── [aad].mdl│ │ │ ├── [arg].mdl│ │ │ ├── [asp,asn].mdl│ │ │ ├── [cys].mdl│ │ │ ├── [dhb,sal].mdl│ │ │ ├── [dhpg,hpg].mdl│ │ │ ├── [glu,gln].mdl│ │ │ ├── [gly,ala].mdl│ │ │ ├── [orn,horn].mdl│ │ │ ├── [phe,trp].mdl│ │ │ ├── [pro].mdl│ │ │ ├── [ser].mdl│ │ │ ├── [thr].mdl│ │ │ ├── [tyr,bht].mdl│ │ │ └── [val,leu,ile,abu,iva].mdl│ │ ├── NRPS2_LARGE_CLUSTER│ │ │ ├── [asp,asn,glu,gln,aad].mdl│ │ │ ├── [cys].mdl│ │ │ ├── [dhb,sal].mdl│ │ │ ├── [gly,ala,val,leu,ile,abu,iva].mdl│ │ │ ├── [orn,lys,arg].mdl│ │ │ ├── [phe,trp,phg,tyr,bht].mdl│ │ │ ├── [pro,pip].mdl│ │ │ └── [ser,thr,dhpg,hpg].mdl│ │ ├── NRPS2_SINGLE_CLUSTER│ │ │ ├── [aad].mdl│ │ │ ├── [ala].mdl│ │ │ ├── [arg].mdl│ │ │ ├── [asn].mdl│ │ │ ├── [asp].mdl│ │ │ ├── [bht].mdl│ │ │ ├── [cys].mdl│ │ │ ├── [dhb].mdl│ │ │ ├── [dhpg].mdl│ │ │ ├── [gln].mdl│ │ │ ├── [glu].mdl│ │ │ ├── [gly].mdl│ │ │ ├── [hpg].mdl│ │ │ ├── [ile].mdl│ │ │ ├── [iva].mdl│ │ │ ├── [leu].mdl│ │ │ ├── [lys].mdl│ │ │ ├── [orn].mdl│ │ │ ├── [phe].mdl│ │ │ ├── [pip].mdl│ │ │ ├── [pro].mdl│ │ │ ├── [ser].mdl│ │ │ ├── [thr].mdl│ │ │ ├── [trp].mdl│ │ │ ├── [tyr].mdl│ │ │ └── [val].mdl│ │ ├── NRPS2_SMALL_CLUSTER│ │ │ ├── [aad].mdl│ │ │ ├── [arg].mdl│ │ │ ├── [asp,asn].mdl│ │ │ ├── [cys].mdl│ │ │ ├── [dhb,sal].mdl│ │ │ ├── [dhpg,hpg].mdl│ │ │ ├── [glu,gln].mdl│ │ │ ├── [gly,ala].mdl│ │ │ ├── [orn,horn].mdl│ │ │ ├── [phe,trp].mdl│ │ │ ├── [pro].mdl│ │ │ ├── [ser].mdl│ │ │ ├── [thr].mdl│ │ │ ├── [tyr,bht].mdl│ │ │ └── [val,leu,ile,abu,iva].mdl│ │ ├── NRPS2_THREE_CLUSTER│ │ │ ├── [hydrophilic].mdl│ │ │ ├── [hydrophobic-aliphatic].mdl│ │ │ └── [hydrophobic-aromatic].mdl│ │ ├── NRPS2_THREE_CLUSTER_FUNGAL│ │ │ ├── [hydrophilic].mdl│ │ │ ├── [hydrophobic-aliphatic].mdl│ │ │ └── [hydrophobic-aromatic].mdl│ │ ├── bacterial_1class.mdl│ │ └── checksums.json│ └── transATor│ └── 2023.02.23│ ├── README│ ├── transATor.hmm│ ├── transATor.hmm.h3f│ ├── transATor.hmm.h3i│ ├── transATor.hmm.h3m│ └── transATor.hmm.h3p├── pfam│ └── 35.0│ ├── Pfam-A.hmm│ ├── Pfam-A.hmm.h3f│ ├── Pfam-A.hmm.h3i│ ├── Pfam-A.hmm.h3m│ └── Pfam-A.hmm.h3p├── resfam│ ├── Resfams.hmm│ ├── Resfams.hmm.h3f│ ├── Resfams.hmm.h3i│ ├── Resfams.hmm.h3m│ └── Resfams.hmm.h3p└── tigrfam ├── TIGRFam.hmm ├── TIGRFam.hmm.h3f ├── TIGRFam.hmm.h3i ├── TIGRFam.hmm.h3m └── TIGRFam.hmm.h3p 31 directories, 124 files ``` 3.9 GB compressed 9.4 GB uncompressed