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Breinholt_et_al_aminoacid_DS1

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DataONE2017-05-18 更新2024-06-26 收录
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Nexus file containing codon position 1 & 2 for 557 loci and 23 taxa. See taxa_list.txt for species names of each taxon, this is a nucleotide nexus file with a CHARSET that defines each gene that starts with codon position 1. Synonymous signal was removed using degen v1.4 Perl script (http://www.phylotools.com), and the third codon has been removed. Loci names correspond to Loci numbers in the Lep1 enrichment kit included in this DRAYD package. For further information see Breinholt et al. (2017) and Breinholt_et_al_Supplementary_File_1_S1-S11.xlsx in this Dryad package for more details.

本数据集为包含557个基因座、23个分类单元第1、2密码子位点的Nexus格式文件(Nexus)。请参照taxa_list.txt文件获取各分类单元的物种名称,该文件为核苷酸Nexus格式文件,其中包含用于定义每个以第1密码子位点起始基因的字符集(CHARSET)。已通过degen v1.4版本Perl脚本(degen,http://www.phylotools.com)去除同义信号,并移除了第3密码子位点。基因座名称与本Dryad数据包中收录的Lep1富集试剂盒(Lep1)内的基因座编号一一对应。如需获取更多详细信息,请参阅Breinholt等人(2017)以及本Dryad数据包中的Breinholt_et_al_Supplementary_File_1_S1-S11.xlsx文件。

创建时间:
2017-05-18
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